Portada » Biología » Mecanismos y Cinética de las Enzimas: Factores Clave en la Velocidad de Reacción Biológica
Cuando un sustrato se encuentra con la enzima correspondiente, se produce la reacción catalizada, la cual se lleva a cabo en tres etapas:
Primero, el sustrato se une a la apoenzima y forma el complejo enzima-sustrato (ES). Esta unión se caracteriza por un alto grado de especificidad, de modo que para cada tipo de sustrato y de reacción se necesita una enzima concreta. La especificidad de una enzima se debe a la estructura proteica de la apoenzima, la cual presenta una zona denominada centro activo, con una forma espacial característica en la que se acopla el sustrato.
En la actualidad se ha probado que en algunas enzimas el centro activo es capaz de modificar su forma para adaptarse al sustrato (modelo de ajuste inducido).
La unión es reversible, ya que una parte del complejo ES se disocia. Debido a esa reversibilidad, esta etapa es la más lenta:
E + S <–> ES
La unión de los residuos (R) de los aminoácidos (Aa) del centro activo al sustrato consigue debilitar sus enlaces, lo que provoca cambios energéticos que permiten alcanzar más fácilmente el estado de transición.
Una vez formado el complejo ES, la coenzima lleva a cabo la reacción y se obtiene el producto final (P). Esta etapa es muy rápida e irreversible:
ES –> E + P
En el caso de no existir cofactores, la acción catalítica la realizan algunos aminoácidos (Aa) del propio centro activo.
El producto se libera del centro activo y la apoenzima queda libre para volver a unirse a nuevas moléculas de sustrato. La coenzima puede liberarse intacta o quedar modificada.
Si se representa gráficamente la velocidad (V) con la que aparece el producto de una determinada reacción enzimática, en función de la concentración de sustrato inicial, se obtiene una curva característica para una cantidad constante de enzima.
En esta gráfica se puede observar cómo al aumentar la concentración de sustrato, también aumenta la V de la reacción, ya que mientras exista enzima libre, a mayor número de moléculas de sustrato, más moléculas de producto aparecerán.
Pero llega un momento en que, aunque la concentración de sustrato siga aumentando, la V no varía (se mantiene constante). Se alcanza una velocidad máxima (Vmax) que no es posible superar. Esta situación corresponde a la inexistencia de moléculas de enzima libre, ya que todas están ocupadas por moléculas de sustrato formando complejos ES.
Al aumentar la concentración de sustrato, existen más centros activos ocupados y la V de la reacción aumenta hasta que no quedan centros activos libres. A partir de ese momento, un aumento de la concentración del sustrato no supone un aumento de la V de la reacción.
Cada enzima tiene un pH óptimo de actuación. Los valores por encima o por debajo de este valor óptimo provocan un descenso de la velocidad enzimática, debido a cambios en la carga eléctrica de los residuos (R) de los aminoácidos (Aa) que están en el centro activo.
De este modo, pueden aparecer o desaparecer enlaces por fuerzas electrostáticas que alteran la estructura espacial del centro activo o su unión al sustrato. También pueden cambiar las cargas eléctricas en el sustrato. En cualquier caso, el acoplamiento del sustrato al centro activo se ve dificultado y la V de la reacción disminuye.
Por debajo de un pH mínimo y por encima de un pH máximo se produce la desnaturalización de la enzima y su actividad se anula por completo.
Como en el caso anterior, existe también una temperatura (T) óptima en la que la actividad enzimática es máxima. Las temperaturas inferiores a este valor óptimo dan lugar a una disminución de la movilidad molecular que hace más lento el proceso, mientras que las temperaturas superiores a la óptima pueden provocar la desnaturalización de la enzima y la pérdida total de su funcionalidad.
Las reacciones biológicas se componen de una secuencia de reacciones encadenadas que constituyen las rutas metabólicas. Estas pueden ser largas, por lo que el tiempo necesario para llevarlas a cabo sería elevado. Para que las reacciones se realicen de una forma óptima, existen diversos mecanismos que aumentan la eficacia de la acción enzimática:
